Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms