Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms