Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHAP12694 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms