Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms