Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms