Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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