Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DENRO43583 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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