Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS4O43181 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS4O43181 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms