Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBDO15205 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBDO15205 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms