Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CEP290O15078 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP290O15078 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP290O15078 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP290O15078 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP290O15078 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP290O15078 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP290O15078 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP290O15078 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP290O15078 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP290O15078 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP290O15078 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP290O15078 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP290O15078 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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