Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms