Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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