Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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