Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms