Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KNCNA6PVL3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms