Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PRAMEF25A6NGN4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PRAMEF25A6NGN4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PRAMEF25A6NGN4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PRAMEF25A6NGN4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PRAMEF25A6NGN4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PRAMEF25A6NGN4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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