Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms