Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms