Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms