Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms