Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPHK2Q9NRA0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms