Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms