Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4CQ9C0C4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms