Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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