Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 AC018647.1-201ENST00000432866 1414 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 TFDP2-209ENST00000477292 1403 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 COMMD3-BMI1-205ENST00000602390 1419 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AP000705.2-201ENST00000433524 1386 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AL161725.1-201ENST00000591577 1351 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AC079316.2-201ENST00000623545 1375 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 B2M-204ENST00000558401 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 CASP12-201ENST00000375726 1306 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 Z82206.1-201ENST00000424496 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AC091078.1-204ENST00000556519 1321 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF525-203ENST00000475179 1868 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 SAMD3-201ENST00000324172 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 KRTAP20-2-201ENST00000330798 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 KRTAP26-1-201ENST00000360542 1193 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AL137792.1-201ENST00000399029 557 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 OR2A12-201ENST00000408949 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKX-AS1-201ENST00000414074 516 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGN1P38-201ENST00000431116 303 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00297-201ENST00000453470 913 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL12P42-201ENST00000481802 499 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AC084871.2-201ENST00000503355 464 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 C8orf87-201ENST00000521906 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 AMN1-207ENST00000536761 1025 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP9-9Q9BYP9 C12orf54-203ENST00000548364 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms