Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THUMPD3Q9BV44 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms