Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms