Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms