Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCF12Q99081 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms