Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT15Q96T59 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms