Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms