Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms