Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEST4Q8NFU0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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