Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms