Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBRM1Q86U86 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms