Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms