Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms