Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms