Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms