Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COBLL1Q53SF7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms