Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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