Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms