Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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