Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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