Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms