Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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