Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms