Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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