Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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NCOA1Q15788 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
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