Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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